Το Μικροβιολογικό Τμήμα είναι μια σημαντική συνιστώσα του ιατρικού ή του εργαστηριακού περιβάλλοντος, εξειδικευμένο στη μελέτη των μικροοργανισμών. Ασχολείται με την ανίχνευση, τον προσδιορισμό και την ανάλυση των μικροοργανισμών που παρουσιάζουν ενδιαφέρον για τη δημόσια υγεία, την ιατρική διάγνωση, τη βιομηχανία τροφίμων και άλλους τομείς.
Οι δραστηριότητες του Μικροβιολογικού Τμήματος περιλαμβάνουν την καλλιέργεια, τη χαρακτηριστική, και την ερμηνεία των μικροοργανισμών σε διάφορα δείγματα, όπως αίμα, ιστοί, ούρα, και εργαστηριακά δείγματα. Επίσης, αναλαμβάνει τη διεξαγωγή ποικίλων δοκιμών αντοχής σε αντιβιοτικά, την παρακολούθηση της μικροβιακής αντοχής, και την έρευνα σχετικά με την πρόληψη των λοιμώξεων.
Οι επαγγελματίες του Μικροβιολογικού Τμήματος συνεργάζονται συχνά με άλλα τμήματα του ιατρικού ή εργαστηριακού περιβάλλοντος για να παρέχουν έγκυρα και αξιόπιστα αποτελέσματα. Επιπλέον, συμμετέχουν ενεργά σε εκπαιδευτικές δραστηριότητες, εκπαιδεύοντας και εκπαιδεύοντας προσωπικό και σπουδαστές στον τομέα της μικροβιολογίας.